Анаксагор был натурфилософом, особенно его интере­совала метеорология: эта наука в античном понимании занималась объектами, находящимися над человеком,— не только атмосферными явлениями, но и небесными све­тилами, звездами и т. п. Анаксагор высказал ряд прогрессивных для своего времени суждений в этой об­ласти. По его мнению, Солнце, Луна, звезды и другие не­бесные тела не являются божествами, как считали его современники, а представляют собой раскаленные камен­ные глыбы огромной величины.

Такой же смелостью отличалась космогоническая тео­рия Анаксагора. По его мнению, в мире не существует возникновения, исчезновения или качественного измене­ния вещей, а есть лишь соединение и разъединение. Таким образом, Анаксагор впервые сформулировал закон со­хранения вещества — правда, в примитивной, наивной форме. Будучи материалистом, Анаксагор не признавал объяснения природных явлений волей божества: считая развитие мира механическим процессом, он не оставлял места богам.

Согласно Анаксагору, материальный мир состоит из бесчисленного множества неизменных телец, названных им семенами. Эти первовещества приводит в движение «разум» (здесь Анаксагор делает серьезную уступку фи­лософскому идеализму). Разум приводит семена в вихре­вое движение, в итоге которого образуется мир.

Суеверные афиняне, услышав, что Анаксагор пропо­ведует истины, граничащие с богохульством (философ осмелился утверждать, будто солнце вовсе не бог Гелиос, огибающий небосвод на огненной колеснице, а раскален­ная каменная глыба, размерами превосходящая грече­ский Пелопоннес), привлекли его к суду по обвинению в безбожии. Лишь заступничество Перикла спасло его от смерти, но он вынужден был покинуть Афины около 432 г. до н. э.